個人簡介
Daniel Falush🙎🏼♀️，生物學博士，中國科沐鸣2上海免疫與感染研究所研究員🏬。1992年於英國劍橋大學獲榮譽學士學位😚，1998年於英國倫敦大學沐鸣2獲得博士學位，先後在日本九州大學💂🏿，德國馬斯克·普朗克進化人類研究所🎇，牛津大學，東京大學，英國巴斯大學等擔任高級研究員🧙🏼。目前在Nature, Science, ISME, Elife, Nature Communications等頂級期刊發表80余篇代表性論文，引用量超過30,000，h指數49👩🏻🦼。主持科技部重點研發項目，國家自然科學基金面上項目👩🏻💻、國家高級外國專家項目，Wellcome Trust Project Grant，Science Foundation of Ireland等多項國內外科研項目。
研究方向
基於生物信息學統計遺傳學，開發新的統計遺傳學方法👭🏼👱🏼，用於分析來自許多不同生物和系統的大規模基因組和宏基因組數據集。
研究重點是從歷史、功能、醫學♦️、生態和進化角度闡述高頻重組物種(如幽門螺桿菌和副溶血弧菌等致病性細菌)中遺傳變異的原因和後果。
榮譽及獲獎情況
2003-2007年 英國Wellcome Trust職業發展研究獎-“細菌變異的統計分析”
2004-2006年 美國環保署頭孢菌素初級研究獎學金👩🏽🦱，林納克沐鸣2
1993-1997年 英國Wellcome Trust，數學生物學獎學金
2021年 愛思唯爾“全球頂尖科學家排名”生物學科前10名國內學者榜單
主持與承擔主要項目情況
2023-2025年 基金委外國資深學者研究基金團隊試點項目
2022-2025年 科技部國家重點研發計劃（子課題負責人）
2022-2026年 國家自然科學基金面上項目
2021-2025年 國家高級外國專家
2014-2019年 英國MRC聯合體指定研究員
2008-2010年 愛爾蘭科學基金會指定研究員
2008-2012年 英國Wellcome Trust (主持人P.Green)，負責“開發克隆框架作為分析細菌序列數據和關聯圖譜的通用方法”
發表論著情況
1.開發的主要軟件：
Linkage model of STRUCTURE、STRUCTURE 2.2⛹🏻、fineSTRUCTURE、ClonalFrame🏸、GlobeTrotter、Badmixture、ClonalOrigin、FineRADstructure等，獲得業內肯定並被大量引用。
2.發表論文80余篇，代表性論文如下🧑🏿🦰：
Falush D. Microbial GWAS coming of age. Nature Microbiology. 2016;1(5)
Leslie S, Winney B, Hellenthal G, Davison D, Boumertit A, Day T, Hutnik K, Royrvik EC, Cunliffe B, Lawson DJ, Falush D, Freeman C, Pirinen M, Myers S, Robinson M, Donnelly P, Bodmer W, Wellcome Trust Case C, Int Multiple Sclerosis G. The fine-scale genetic structure of the British population. Nature. 2015;519(7543):309-+.
Hellenthal G, Busby GBJ, Band G, Wilson JF, Capelli C, Falush D, Myers S. A Genetic Atlas of Human Admixture History. Science. 2014;343(6172):747-51.
Sheppard SK, McCarthy ND, Falush D, Maiden MCJ. Convergence of Campylobacter species: Implications for bacterial evolution. Science. 2008;320(5873):237-9.
Harter AV, Gardner KA, Falush D, Lentz DL, Bye RA, Rieseberg LH. Origin of extant domesticated sunflowers in eastern North America. Nature. 2004;430(6996):201-5.
Falush D, Wirth T, Linz B, Pritchard JK, Stephens M, Kidd M, Blaser MJ, Graham DY, Vacher S, Perez-Perez GI, Yamaoka Y, Megraud F, Otto K, Reichard U, Katzowitsch E, Wang XY, Achtman M, Suerbaum S. Traces of human migrations in Helicobacter pylori populations. Science. 2003;299(5612):1582-5.
Lawson D, van Dorp L, Falush D. A tutorial on how not to overinterpret STRUCTURE or ADMIXTURE bareplots. Nature Communications. 2018 9: 3258.
Harry A. Thorpe, Elise Tourrette, Koji Yahara, Filipa F. Vale, Siqi Liu, Mónica Oleastro, Teresa Alarcon, Tsachi-Tsadok Perets, Saeid Latifi-Navid, Yoshio Yamaoka, Beatriz Martinez-Gonzalez, Ioannis Karayiannis, Timokratis Karamitros, Dionyssios N. Sgouras, Wael Elamin, Ben Pascoe, Samuel K. Sheppard, Jukka Ronkainen, Pertti Aro, Lars Engstrand, Lars Agreus, Sebastian Suerbaum, Kaisa Thorell & Daniel Falush (2022). Repeated out-of-Africa expansions of Helicobacter pylori driven by replacement of deleterious mutations. Nature Communications,6484(2022)
聯系方式
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